食管癌放療的不良反應主要分為全身性反應和局部反應兩方面。全身性的反應臨床發生概率較小，患者主要表現為乏力、精神差、食欲減退等。 放療局部反應分食管和氣管兩個部位的局部反應，射線直接照射食管會引起局部的放射性食管炎，放射性食管炎最典型的癥狀為進食后食管劇烈疼痛，這種疼痛會影響患者進食，因食管黏膜局部有時會有充血水腫的情況，還會伴發吞咽困難的加重，這些情況主要發生在放療的過程中期。雖然隨著放療技術逐步發展越來越精準，但因食管位于縱隔的最中部，射線達到腫瘤病灶時難免會穿過正常的肺組織從而對氣管黏膜造成損傷，所以這時可能會引起輕度的咳嗽伴氣喘等癥狀。