急性腎盂腎炎的治療，主要針對引起急性腎盂腎炎的致病菌，分別選用敏感抗生素進行治療，常見致病菌包括：1、大腸埃希菌，即大腸桿菌；2、克雷伯桿菌；3、綠膿桿菌；4、少數情況下還可以見到金黃色葡萄球菌、草綠色鏈球菌以及表皮葡萄球菌等。因此對于急性腎盂腎炎的患者，除做尿常規、血常規檢查外，最好能夠做清潔中段尿培養，明確致病菌，再選用敏感抗生素進行治療，藥物如下：1、頭孢類抗生素：主要針對大腸桿菌感染，如頭孢西丁、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢哌酮；2、喹諾酮類抗生素：常用左氧氟沙星、莫西沙星；3、糖肽類抗生素：如果是金黃色葡萄球菌引起的急性腎盂腎炎，需要選用萬古霉素進行針對性抗感染治療。