軟組織疾病通常需要進行核磁共振檢查，由于部分軟組織由骨性結構包裹，其中的結構通過超聲、X線等難以明確，因此需要進行核磁共振的檢查，通常臨床中還有以下疾病需要進行核磁共振檢查：1、腦部疾病：如果腦部出現腦梗死、腦腫瘤、腦部炎癥等疾病，通常需要通過核磁共振檢查；2、脊髓疾病：如果患者為脊髓疾病，例如脊髓血管疾病、血管畸形、脊髓缺血或脊髓炎、脊髓壓迫癥等，通常需要核磁共振檢查；3、其它疾病：關節韌帶損傷、肌肉疾病，心臟、心肌疾病，都可以進行相關的核磁檢查。肌肉病、關節損傷的疾病需要做核磁共振檢查，心臟核磁主要用于心肌病的判斷，判斷心臟是否有心肌纖維化。對于其它系統而言，例如骨性結構改變需要對骨骼進行檢查，通常不建議做核磁共振的檢查。