肛門疼痛常見原因有以下幾點：1、肛裂：當肛管上有裂口，此時疼痛較有特點，在大便時比較疼痛，大便后還會疼痛一段時間，此時通常稱為節律性疼痛，應做肛門檢查明確原因，并對癥治療；2、肛周膿腫：肛周膿腫是肛周有細菌感染，造成局部出現癤膿、膿包，此時肛門周圍會出現硬塊，觸摸疼痛，且周圍皮膚溫度增高，有紅、腫、熱、痛等癥狀。有些膿腫較深，表面摸不到包塊，但會出現疼痛，甚至發熱，此時應及時就醫，必要時進行手術；3、血栓性外痔：血栓外痔疼痛是肛門口出現紫黑色硬塊，觸摸較硬，此時通常需要手術切除。若出現血栓性炎性外痔，當痔瘡在外面出現炎性改變后會出現疼痛；4、混合痔嵌頓：許多痔核卡在肛門口無法進入時，此時會引起疼痛；5、腫瘤：此原因較為少見，若肛門周圍出現腫瘤，如肛管癌、肛門周圍黑色素瘤等晚期時會引起疼痛。