醫生不建議進行核磁共振檢查的原因可能有以下幾種：
1. 幽閉恐懼癥：患有幽閉恐懼癥的患者不建議做核磁共振，因為他們進入比較封閉的環境會出現異于常人的表現，如緊張、恐懼、瀕死感等，而做核磁共振正是需要進入這種環境內完成的，患者很可能會出現身體不適，所以醫生會不建議此類人群做核磁共振。
2. 孕婦：特別是在懷孕的前三個月的時期，不建議做核磁共振，因為這個時期是胎兒生長發育的關鍵時期，而做核磁共振的過程中，會產生很多噪音和能量，可能影響到胎兒的生長發育。
3. 攜帶金屬制品：如體內裝有心臟起搏器、口腔金屬牙套、身體骨折處鋼板等金屬制品的患者不建議做核磁共振，因為核磁共振機器有強大的磁場，可能會干擾心臟起搏器的正常工作，或者金屬制品會影響核磁共振的成像，導致成像質量下降，影響對疾病的判斷。
4. 檢查部位：核磁共振的成像原理主要是利用磁場引起體內水分子位置的改變而進行分析觀察，有些部位的含水量較少、氣體較多，亦或是存在不停的搏動，如胃部、心臟等，無法清晰的成像，可能會影響對疾病的判斷，所以醫生會不推薦做核磁共振。
5. 價格原因：由于核磁共振的價格是根據部位進行收費的，價格會相對較高，對于沒有必要進行核磁共振檢查的患者，醫生可能會出于經濟原因不建議其進行此項檢查。
總的來說，醫生根據患者的實際情況和檢查需求，會針對個別案例不建議進行核磁共振檢查。
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