陰莖萎縮的主要原因如下：1、生理性問題：陰莖萎縮一般是生理性問題引起的，首先表現為隨著年齡增長，陰莖可以出現逐漸地減小，還有就是肥胖患者，肥胖以后就會出現陰莖埋藏在脂肪堆里，出現陰莖相對萎縮。還有生活的環境，比如寒冷、精神緊張、疲勞后，會出現陰莖的相對縮小，這些都是生理現象，不需要特殊處理；2、病理性問題：在現實生活當中，因為這類問題，有些人形成心理負擔以后，就形成了所謂的縮陽癥，患者感覺到陰莖的萎縮或者回縮，往往出現恐懼心理，癥狀持續數分鐘到十幾分鐘，但容易復發。這一類問題是一個精神心理的問題，通常見于南方，尤其以農民比較多見，受教育的程度比較低，性觀念或者性知識比較缺乏，封建意識比較濃厚。對于這類問題的處理，通常是應用心理輔導的方式，緩解患者的焦慮心情，同時要破除封建迷信，讓患者具備一些相關的性知識，明確所謂的縮陽癥的心理情況，必要時可以應用抗焦慮以及鎮靜的藥物。