膽囊萎縮是因炎癥反復刺激逐步形成，特別是合并相關病因沒有去除，比如膽囊結石，未進行手術治療的情況。一般較大的結石無法自行消除，且又容易對膽囊壁造成刺激，引起膽囊反復炎癥，從而引起膽囊壁增厚。增厚的膽囊壁會出現纖維組織增生、攣縮，導致膽囊失去其原有彈性，膽囊逐漸萎縮、縮小，甚至于直接附著于膽囊結石上，引起充滿型膽囊結石。膽囊失去其原有能夠儲存膽汁的功能，因為無法進行膨脹，也無法儲存更多膽汁，此時膽囊萎縮需要手術治療，特別是合并膽囊內大量結石時，建議更要早期手術治療。因為萎縮性膽囊炎會有癌變風險，早期手術可以預防后期出現嚴重的風險以及并發癥，膽囊萎縮的患者也要注意飲食調控，禁忌高脂肪、高膽固醇的食物，戒煙、戒酒等。