若機體缺少碘時，容易發生甲狀腺功能減退癥，其中最常見的疾病是地方性甲狀腺腫伴甲狀腺功能減退癥。因為某些地區的食物含碘少且遠離海邊。而食物中碘少，可使合成甲狀腺激素的原料減少。甲狀腺激素的合成條件是機體有碘以及有合成甲狀腺激素的場所，而甲狀腺激素合成場所是甲狀腺。大多數碘都在甲狀腺細胞內聚集，經過甲狀腺上皮細胞碘化酪氨酸，可形成單碘酪氨酸、雙碘酪氨酸、三碘酪氨酸、四碘酪氨酸，即合成甲狀腺激素。由于碘缺乏，導致合成甲狀腺激素的原料缺乏，此時容易發生甲狀腺功能減退癥。在患病早期機體可通過促甲狀腺激素水平升高，使甲狀腺組織增生、肥大。但此類肥大是代償性肥大，是機體使甲狀腺多合成甲狀腺激素。但若增大的甲狀腺仍不能夠滿足機體需要的甲狀腺激素，此時會發生地方性甲狀腺腫伴甲狀腺功能減退癥。但現在地方性甲狀腺腫伴甲狀腺功能減退癥已經很少見，因為缺碘地區的食鹽中已加入碘劑。