牙周膿腫如果做徹底牙周治療，一般能夠消退。如果仍無法消退，需明確原因，可進行拔除。一直無法消除可能是機體抵抗力降低、全身疾病或自身免疫性疾病導致。一般情況下，牙周膿腫因為牙周有窄而深的袋形成，牙周膿腫除做基礎治療、全身用藥外，牙周袋內可以放置緩釋藥。 口腔內的感染為厭氧菌感染，厭氧菌感染多使用甲硝唑、替硝唑類的抗感染。將甲硝唑做成長條狀放在牙周袋內，可以較好的消除牙周袋內炎癥。