胃鏡檢查的頻率要根據患者病情確定，如果患者只是一般性疾病，如慢性淺表性胃炎，在沒有特殊癥狀的情況下，可能2-3年甚至3-5年再做1次即可。如果患者有萎縮性胃炎伴腸化，甚至不典型增生，這時醫生會建議每1-2年復查1次。 如果患者是較急、較重的疾病，如急性上消化道出血，初次檢查胃鏡明確病因，甚至做內鏡下止血治療后，患者仍然有反復出血，在使用藥物效果欠佳的情況下，有時上午做完胃鏡，下午根據情況可以再次做胃鏡檢查。 因此，在醫生操作比較熟練的情況下，短期內做胃鏡檢查對病人本身沒有太大傷害，主要需根據病情決定。