做胃鏡需5-10分鐘，患者在檢查前會服用去泡劑，將胃內黏液清洗干凈，以便醫生檢查。檢查前予患者咽喉部用應用局麻藥，以減輕患者惡心、嘔吐等反應，待一切準備就緒，醫生將胃鏡插入，觀察食管、賁門、胃、十二指腸等部位，并不斷幫患者清洗胃內殘留泡沫、黏液，若發現炎癥、潰瘍、息肉、腫瘤等病灶，則會拍照記錄，最后做活組織檢查。此外，醫生還會做幽門螺桿菌的檢測。仔細檢查后清除胃內氣體，退出胃鏡。患者只要放松，通常可較好配合。