腦膿腫通常可被治愈。身體其他部位發生膿腫，可能較容易理解，例如手劃破，細菌進入形成膿腫。而腦膿腫通常由細菌引起，通過血液循環播散、停留于腦組織中，繼而形成膿腫，部分細菌通過破潰、中耳炎、鼻竇炎在腦中形成膿腫。腦膿腫主要為細菌感染性疾病，早期膿腫壁未形成時不能貿然手術，而應使用敏感的抗生素，進行長療程、縮量治療。膿腫壁形成后再采取外科治療，例如穿刺抽吸、反復的沖洗，使膿腫體積明顯縮小后，再行后續加強的抗生素常規治療。對于較淺表的腦膿腫，若膿腫壁已經形成且較堅實，也可行開顱剜除膿腫手術。此時，應注意保證膿腫壁的完整性，切勿破壞蛛網膜下腔，若在手術過程中，大量膿液流入蛛網膜下腔使炎癥和細菌播散，可能導致嚴重的后果。