顱內的多發性腦囊腫可以治愈，但在進行治療之前一定要先明確原因，比如身體的其他部位是否存在感染灶，因為會影響到顱內，引發一系列腦囊腫的情況。需要針對這些原因進行治療，而且同時要進行抗生素的規范用藥，一般需要用到六周左右的抗生素規范治療，這樣有一部分腦囊腫可以被控制住。對于比較嚴重的腦囊腫，經過規范治療后也可以達到膿腫局限的目的。針對局限的腦囊腫，也可以通過外科手術的方式來進行切除，比如傳統的開顱手術，把囊腫整個切除，或者通過穿刺的方式放置一根引流管，將膿液引出體外，也能達到治愈的目的。