小兒急性腎功能衰竭的預后與原來疾病、對腎臟以及機體傷害密切相關，總體來說預后可能會較好，可能相對較差。有數據研究表明，如果單純因為感染性休克、血容量不足引起的急性腎損害，通過及時有效治療后，腎功能可能會較快恢復，大部分患兒腎功能可恢復正常。 另外，可能有部分特殊因素，比如藥物傷害引起，或者其它炎癥因子引起。處理過程中需觀察患者對藥物的敏感性，即藥物對腎臟的損害可為藥物敏感性問題、濃度問題。腎臟損害可能相對恢復較慢，前提為進行正確恰當處理。如果小兒急性腎功能衰竭發現不及時，診斷、處理不及時，預后相對可能會較差，有可能會造成永久性腎功能損害，需替代治療。小兒腎功能衰竭的預后取決于早期診斷、早期治療，以及積極采取防御措施。