甲胎蛋白在臨床上屬于反應肝臟腫瘤或肝癌相對特異的標志物。如果甲胎蛋白偏高，建議進一步地進行肝臟相關檢查，如腹部超聲，可以在肝、膽、胰、脾、腎等部位檢查，也可以進行腹部CT、核磁檢查，主要針對肝臟進行檢查，明確是否存在肝臟病變。當甲胎蛋白水平很高或從低濃度逐漸升高不降，更多考慮為肝臟腫瘤問題。但甲胎蛋白水平偏高也不一定均由于肝癌導致，比如由于某些原因導致的肝炎，如各種急慢性肝炎，也可能會引起甲胎蛋白增高。如果女性在孕期進行甲胎蛋白檢測，則會發現甲胎蛋白處于生理性輕度增高的狀態，此時與懷孕狀態有關。因此，當出現甲胎蛋白增高時，需要重點排查肝臟疾病，可以進行超聲、CT、核磁共振等檢查。