真菌性龜頭炎與細菌性龜頭炎的區別在于兩者癥狀、治療不同，所以在治療龜頭炎時，大概可以區分出是真菌感染還是細菌感染，選擇有效的抗生素對癥處理，能夠使龜頭炎早日康復。1、癥狀：真菌性龜頭炎主要是由于真菌感染造成的龜頭發炎，在龜頭表面會出現紅斑，紅斑表面光滑、邊緣整齊，有時伴隨有皰疹或瘙癢。細菌性龜頭炎大多由細菌引起，有球菌感染、桿菌感染，表現為龜頭表面充血、水腫、疼痛，有時伴隨潰瘍或化膿，有時表面有濕疹，瘙癢明顯，分泌物增多；2、治療：真菌性龜頭炎主要用針對真菌的藥物治療，如克霉唑軟膏、達克寧栓，也可以口服抗真菌的藥物，如酮康唑。細菌性龜頭炎多選用廣譜抗生素的軟膏，如百多邦(莫匹羅星軟膏)、大環內酯類的紅霉素軟膏。而且在治療細菌性龜頭炎的時候，多口服應用抗生素，可以口服羅紅霉素、阿奇霉素等，有時選擇喹諾酮類抗生素，如環丙沙星、左氧氟沙星等。