后腦兩側疼痛的原因如下：1、頭顱問題：后腦部位是小腦、腦干、血管環(huán)存在的部位，如果罹患占位性病變或者血管性病變，患者出現(xiàn)后腦兩邊疼痛癥狀，建議進行頭顱核磁共振檢查，以及頭顱血管的相關檢查，明確是否存在器質性病變，有高血壓冠狀動脈硬化的患者需特別注意；2、頸源性頭痛：目前頸椎病發(fā)病率較高，頸椎退變、曲度變直、頸椎小關節(jié)病變、頸肩部肌肉緊張和痙攣等均會刺激頸神經產生疼痛。表現(xiàn)為后腦兩側疼痛或整個頭顱疼痛，建議進行頸椎核磁共振檢查，排除頸椎部位器質性病變，如明確為椎體病變或延髓病變后，需進行頸神經阻滯治療；3、睡眠不足：后腦兩邊疼痛還可能由于睡眠不足導致。