腦干梗塞是否在第5天就會發生病危，需要視梗塞的部位來定，還有是否合并有大血管病變。如果是供應腦干的大血管有比較嚴重的狹窄，在急性期又沒有給予很好的干預，隨著病程進展，累及延髓的時候，可能在急性期內會出現病危的癥狀。腦干梗塞在急性期，尤其是發病的首2周內都有一定風險。風險的大小視腦干梗塞的部位以及病程進展來定，腦干梗塞如果發生在中腦和腦橋部位，通常會影響眼球運動和說話，出現面癱以及肢體癱瘓。延髓是生命的中樞，心跳和呼吸中樞都在延髓。如果腦干梗塞的部位發生在延髓，或者腦干梗塞在急性期沒有得到較好的處理，隨著病程進展，病變部位累及延髓，此種情況是比較危重的。患者可能會突然出現呼吸、心跳驟停，而出現急性死亡。