腦干梗死的癥狀可能不重，這種情況僅限于穿通動脈梗死，可能也限于某些部位的穿通動脈梗死，比如橋腦部位出現穿通動脈梗死。橋腦部位的錐體束比較散，較為發散。所以橋腦梗死引發的癱瘓是肢體的不全癱，不是絕對的一側肢體偏癱，可能某一個肢體比較重。有時穿通動脈梗死可避開錐體束，正好蓋住小的穿通動脈，梗死之后可能僅限于某些運動神經核團出現破壞。在俯側面，因為錐體束走行于俯側面，被蓋住的損傷不影響錐體束，所以其引起的肢體的神經功能缺損癥狀可能比較輕。但是如果發生在較大的皮層、皮質，引發的腦干梗死病情則較重。