體外沖擊波碎石對腎臟有一定的損傷，而且腎臟損傷是體外沖擊波碎石嚴重的并發癥之一，可以造成永久性腎損傷。常見的腎臟損傷包括腎臟的包膜下血腫、腎盂破裂、腎單位永久性損傷、完全的腎乳頭壞死，以及彌漫性纖維化、瘢痕化，甚至出現急性腎功能衰竭。體外沖擊波的空化效應和應力效應是造成腎損傷的主要原因，通常在老年人多見一些，尤其是有凝血功能異常、服用了阿司匹林藥物等情況下，發生的概率要高一些。因此在治療中，降低沖擊波的次數、頻率和能量，對降低腎臟損傷有幫助，同時還可以提高誤識率。如果是小的包膜下血腫，一般通過保守處理即可好轉。對于較大的包膜下血腫，必要時進行穿刺引流。如果造成了腎臟實質損傷，需要進行介入栓塞或者腎臟修補，嚴重的需要行腎臟切除手術。如果出現尿液外滲，需要進行尿液引流，來達到處理的目的。