慢性再生障礙性貧血分輕型和重型，輕型再生障礙性貧血，首先給予環孢素免疫治療，還有給予促造血作用的雄激素治療。而慢性再障中的重型再生障礙性貧血，除免疫治療外，建議進行骨髓移植治療。骨髓移植治療是根治再生障礙性貧血的方法，但骨髓移植有一定風險，因異基因的骨髓移植，可能會出現移植物抗宿主病。 如果再生障礙貧血病人出現重度貧血，可以對癥輸血治療。如果白細胞明顯低下，可以用升白針促進白細胞生長。血小板極低的病人有出血風險，可以輸注血小板預防出血。也可以用促進血小板生長藥物，如艾曲波帕進行治療。