功能性腹瀉在臨床上比較常見，經過排查比如做了腸鏡、便常規、便培養、全身體檢，檢查以后沒有明顯器質性病變而出現大便次數增多，尤其是每天＞3次的稀便、水樣便但不伴有腹痛、腹脹、腹部不適的情況，定義為功能性腹瀉。功能性腹瀉和細菌、病毒感染不相關，沒有這些因素的誘發，最近研究，主要的病因是腸道菌群和神經功能紊亂而導致泄瀉，尤其是腸道菌群，腸道微生態失衡、菌群失調。目前腸道發現的菌群數目大概有數萬億，能培養出來的菌株、菌種大概有500-1000多種，近年來腸道菌群失調和紊亂是功能性腹瀉研究的熱點。