臍血穿刺比羊水穿刺的風險高，臍血穿刺通常在羊水穿刺不能代替的情況下選擇，如對胎兒進行宮內輸血，或是孕周過大已經錯過羊水穿刺的時機，以及需對小孩進行血型鑒定等。臍血穿刺有利有弊，一方面能及時準確的了解胎兒，抽胎兒自身的血很直觀。另一個方面因為臍帶漂浮于羊水中，經臍血穿刺后，穿刺點若止血效果不佳可能會導致血腫，甚至臍血丟失，導致胎兒貧血等。目前，可以做羊水穿刺的孕周較之前的時間更長，從十六周開始，一直到二十幾周，取代了部分臍血穿刺。