男性慢性生殖系統感染，能查到病原體。男性慢性生殖系統感染，需要行抗生素或其他藥物治療兩周。在兩周后，再進行生殖系統檢查，如通過精液細菌培養，通過精液支原體、衣原體培養，通過精液真菌培養，通過精液淋球菌培養，常常能找到致病微生物。通過選擇有效的抗生素和中成藥物聯合治療，多數男性慢性生殖系統感染引起的不適癥狀，會明顯好轉。男性出現慢性生殖系統感染時，治療上常常不規范，導致在檢查時，常常不能發現致病微生物，如做尿液檢查時，發現不了致病菌。這是由于男性發生前列腺炎或泌尿生殖道感染時，很少會引起尿液改變，所以通過尿常規檢查，通常找不到致病微生物。另外，前列腺液分泌量非常少，所以在做前列腺液病原微生物檢查時，也找不到病原微生物。國際上通常采用精液檢查，在停藥兩周后，做精液病原微生物培養，一般能找到致病菌。