甲狀腺囊腫和甲狀腺結節的發病機理一致，表現形式不同。結節增生到一定程度會產生退變，壞死后形成空腔，液體較多的囊泡可形成囊腫，有時囊腫內液體吸收，完全會變小，形成結節。一般結節實性、較硬，B超影像顯示其為實質性腫塊，稱之為結節。如果B超影像顯示其有大量液體，腫塊為囊性樣改變，則稱之為囊腫。 二者沒有實質上的區別，治療手段基本一致，少數囊性為惡性腫塊，臨床上發現囊性物質內有大量水分，實際上其為甲狀腺癌的另外一種表現，所以囊腫也要做鑒別診斷。