臨床上分辨膽管腫瘤是良性還是惡性的主要方法有以下幾種：1、影像學診斷：包括增強CT以及增強磁共振，可以提供相關的依據，大致分辨是良性肝臟腫瘤，還是惡性膽管癌等。但影像學診斷仍然有一部分出錯的可能性，并不能保證100%精準，如部分炎癥與腫瘤，在影像學上的表現非常類似；2、血液學診斷：結合抽血的結果，如CEA(癌胚抗原)、CA19-9、CA12-5等腫瘤標記物升高的情況。但血液學檢查也無法100%保證一定是良性或惡性，不是定性診斷的方法，僅供臨床醫生參考；3、組織活檢：可100%確診，即從腫塊取一部分組織，拿出體外后進行免疫組化等一系列分析，從而明確腫瘤良性還是惡性。但這種方法受腫瘤部位、患者身體情況等諸多因素控制。因為穿刺活檢有一定的創傷和風險，可能穿刺后并沒有取到腫瘤組織，而是取到旁邊的正常組織，尤其是腫瘤較小時，所以這種方法也有一定的缺陷。臨床上需要結合諸多情況，包括影像學、血液學診斷以及穿刺活檢的診斷，綜合考量，幫助明確是良性還是惡性。