磁共振檢查對人體沒有傷害，所以小孩檢查磁共振對身體沒有傷害。核磁共振的成像主要通過外磁場作用于人體，再通過電磁的脈沖射頻作用人體中的氫原子核，氫原子核產生共振發生信號，再經過的計算機吸收信號轉換圖像，而CT是通過X線成像，所以核磁共振的檢查對身體沒有任何傷害，也非常安全。 到目前為止沒有核磁共振檢查對身體有傷害的相關報道，特別是懷疑胎兒畸形時，做完B超以后要進一步做檢查，也可以利用核磁共振對胎兒畸形判斷。既然可以用于胎兒進行檢查，所以小孩能用核磁共振檢查的盡量使用磁共振檢查，少做CT。