功能性胃腸疾病可以自愈，但需注意生活方式，有些人由于飲食不規律或生活習慣存在問題，如吸煙、喝酒、長期熬夜、愛生氣導致功能性胃腸疾病，屬于一種心身疾病，建議改善生活方式、改善飲食、情緒調理后，完全可以自愈。 反復發作的病人，飲食上應避免進食肥甘厚膩、辛辣刺激性食物，勿暴飲暴食，建議少食多餐。生活上應加以注意，不要過度熬夜、勞累，以免影響胃腸道功能，同時需調整心態，以促進恢復。