漱口水屬于牙周炎輔助用藥，故對牙周炎治療具有輔助作用，主要用于預防和減少牙菌斑發生。漱口水具有抗菌作用，可以消除或者是減少口腔內微生物，防止細菌在牙面和牙周袋內繁殖，防止炎癥發生。但漱口水在口腔內停留時間較短，進入齦下深度小于1mm，所以其作用有限。 對于牙周炎藥物治療，通常在用藥之前均需先清除牙周菌斑與牙石，去除局部刺激因素，然后再輔以口服或漱口水等局部藥物。目前臨床上漱口水品種較多，如洗必泰、氯己定、替硝唑等，均對牙周炎有一定控制作用。