前列腺肛門物理治療有效，但不是一種較好的方法，因為此方法造成的損傷、不舒服癥狀有很多。采用的方法往往是療效好、痛苦小、盡量不侵入肉體的方法，因為侵入以后，會造成不必要的問題，包括感染、損傷、肛門墜脹的不舒服癥狀，都是侵入治療的不良反應。因此可以選用前列腺的深部熱療、盆底強磁治療，還有生物反饋治療，以及激光、短波的微波治療，都是非侵入性的檢查，也有良好的治療效果。前列腺疾病包括前列腺炎、前列腺增生，物理治療是常用的一種方法。臨床上最常用的方法還是深部熱療、盆底強磁和短波治療的非侵入、非插入肛門的物理治療方法，其比插入肛門的物理治療方法好，所以臨床上不首先選擇侵入肛門的物理治療。