重癥肌無力的病因尚不明確，導致重癥肌無力的機制是神經肌肉接頭的抗體增加、遞質減少，出現肌肉的無力。抗體增加主要與自身免疫有關，引起自身免疫紊亂的原因包括胸腺瘤，即胸腺的增生導致機體的免疫紊亂，出現抗體增加。此外還有甲亢，甲狀腺機能亢進是身體的免疫功能紊亂所致，甲亢導致甲亢性疾病，進而導致肌肉的病變。還有不明原因的免疫紊亂，需對癥處理，調節免疫，當抗體過高時，可用激素、免疫抑制劑進行治療。