非淋球性尿道炎的治療費用與病程長短有關系，其敏感性藥物價格不高，如紅霉素、羅紅霉素、多西環素等。臨床醫生會搭配中成藥輔助，費用會有所增加。如支原體或衣原體感染，用藥療程約需2周，1-2周的治療費用約200-300元。如果反復發作，費用會根據療程增加。目前很多藥物已納入醫保，是國家基本藥物或省級基本藥物，用醫保藥物，報銷力度大，能大大減輕患者的負擔。 具體用藥請咨詢臨床，以醫生面診為準。