CT利用X光，有輻射。而核磁共振是原子核在磁場中磁力發生共振而產生的圖像，是磁場，不是X線，所以沒有輻射，一般不會對人體產生任何危害。 但是磁共振的磁場強度非常高，對于早孕，尤其懷孕3個月以內的孕婦，盡量不要做磁共振檢查，因為場強很強，可能會對胎兒造成一定影響，影響并不是輻射造成，而是磁場造成。正常人做磁共振沒有任何問題，但是磁共振檢查也有一定禁忌癥，比如患有幽閉綜合征、重癥佩戴呼吸器、心臟起搏器患者等。 最近幾年新研發心臟起搏器可以做磁共振兼容，需要臨床心內科醫生將其調到磁共振狀態，才可以進行磁共振檢查。