常見的卵巢腫瘤標志物包括CA12-5、甲胎蛋白、CA19-9及鱗狀上皮內抗原等。腫瘤標志物可于一定程度上輔助判斷卵巢腫瘤的良惡性，但腫瘤標志物升高并不代表卵巢腫瘤一定屬于惡性。 其中CA12-5升高既可以由于卵巢癌導致，也可以由于卵巢良性腫瘤、卵巢巧克力囊腫、子宮內膜異位癥、子宮腺肌癥、盆腔炎引起。此外，妊娠女性也常出現CA12-5在短期內升高。