全血細胞減少常見于血液系統疾病，以及繼發于其他疾病。全血細胞減少指外周血中白細胞、紅細胞、血紅蛋白與血小板均減少，最常見的原因是骨髓造血功能抑制，比如再生障礙性貧血，為骨髓造血功能衰竭導致外周血的全血細胞減少。當骨髓造血系統出現惡性的血液系統疾病，如急性白血病、骨髓增生異常綜合征以及淋巴瘤、多發骨髓瘤等，對骨髓的正常造血功能造成影響，也會表現為外周血的全血細胞減少。造血原料缺乏，如葉酸、維生素B12以及鐵嚴重缺乏，也會導致全血細胞減少。當脾臟腫大時，脾臟破壞血細胞的能力增加，也會出現外周血的全血細胞減少。自身免疫性疾病，如系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征，因為體內有大量的抗體，會導致免疫性的全血細胞減少。