先天性黃疸包含有先天性非溶血和非梗阻性黃疸。主要是干細胞對于膽紅素攝取、結合及排泄，由先天性酶缺陷引起黃疸臨床較少見，多發生于兒童或青年期人群，均存在家族史，但多數患者的健康狀態良好。先天性非溶血性黃疸包括有Gilbert綜合征，Dubin-Johnson綜合征，Rotor綜合征和Crigler-Najjar綜合征。其中Crigler-Najjar綜合征是最嚴重的一型，預后較差。