在涉及腦部疾病，尤其是需要做手術時，則需要進行腦部高級功能評價。如癲癇的治療需要找到致癇灶，定位腦功能；大腦里出現了腫瘤，同樣需要去評價大腦與腫瘤的關系。高級腦功能評價對于治療整個神經科的疾病均非常重要。常用的檢查如認知功能的檢測，包括記憶里的檢測、IQ智能檢測、空間判斷力等；另外還有顱內檢測以及在術中喚醒的情況下進行腦功能的檢測，這些檢測有助于大腦疾病的治療。