輕度腦炎的恢復時間與感染類型及患者體質有關，臨床中以1周作為恢復周期。若患者體質較強壯，且無明顯基礎性疾病，則恢復相對較快，2周即可痊愈；若患者體質較差，合并基礎疾病較多，則預后較差，可有并發癥發生，恢復時間相應較長。此外，不同患者患輕度腦炎后的癥狀亦不同，多數患者經系統治療，可得較好療效。少數患者治療后，仍有認知功能障礙、癲癇發作、長期慢性頭痛等后遺癥。