早期胃癌內鏡下的鑒別診斷借助于規范的內鏡操作、清晰的胃鏡視野以及黏膜的清晰程度。在胃鏡檢查中要發現并鑒別發紅的病灶、淺表凹陷的病灶，還要特別注意有無毛刺樣改變，有無清晰的邊界，以及表面的微結構，包括腺管的微結構、微血管的結構改變。在這些改變當中，能夠發現早期病變。胃竇的胃癌是以分化型為主，早期胃竇癌大部分是ⅡC型，而賁門胃底的胃癌以未分化、低分化為主。