兒童慢性腹瀉，多因沙門氏菌引起，痢疾亦屬常見致病菌，均具有一定傳染性。治療前首先進行便常規檢查、藥敏試驗，查清引起腹瀉的原因。不同細菌感染，選用不同抗生素，同時慢性腹瀉的治療，需注意飲食控制，做好腸道營養，或腸外營養補充，因長期腹瀉，可引起兒童營養不良，及時補充足夠營養至關重要。此外，還可進行中醫中藥治療，使用健脾、收斂、止瀉類中成藥或中藥飲片，通過熬湯、食療，均可起到較好效果。