引起慢性腹瀉的原因較多，可分為感染及非感染兩類，常見如下：1、感染性：若患者感染細菌、病毒、寄生蟲或真菌等，會引起感染性腹瀉；2、非感染性：非感染性腹瀉較多，如膽囊切除術后患者可以出現腹瀉，慢性肝炎、慢性胰腺炎、膽囊炎、膽囊結石等肝、膽、胰疾病，也可引起腹瀉癥狀。消化道腫瘤尤其結腸腫瘤、直腸腫瘤的患者，會出現腹瀉癥狀，胃泌素瘤會導致胃酸分泌過多，此時患者會表現為腹瀉。此外當患者出現甲亢、糖尿病等全身性疾病時，也可以引起腹瀉。