肝吸蟲病常見并發癥主要是急性膽囊炎、膽管炎、急性膽管炎性狹窄、膽結石、急性膽管梗阻性黃疸；慢性重癥會出現肝硬化并發癥。此外，可造成肝癌、膽管癌等常見的并發癥。如果大量肝吸蟲突然釋放，可能造成急性梗阻性黃疸，多數潛伏期較長，起病較慢，逐漸出現上腹部飽脹感、疲乏感，如果出現膽管炎、膽囊炎亦為逐漸出現，僅少部分患者是急性發病過程。