對于具有手術指征的腸結核患者，需要進行急診手術。由于腸結核患者通常合并有腸道粘連，整個腹膜炎體征相對較重，且術中出血較多，具體手術方式根據手術探查情況選擇，常規進行開腹手術。對于患者腹腔粘連很重，病變范圍較多，可能需要部分腸管切除。如果合并有腹腔巨大膿腫，不能在Ⅰ期進行手術，或Ⅰ期手術完成后很快發生腸瘺等情況，可以在炎癥控制2-3個月之后，選擇Ⅱ期手術進行腸子還納。