肛周膿腫較難自愈，該病為肛周特殊部位感染，即肛門部肛腺感染，沿皮膚和黏膜間隙潛行擴散，故有別于體表癤、癰感染。因皮膚和黏膜比較牢固，不易突破，故局部或全身用藥很難控制，微小肛周感染，可通過局部坐浴，口服消炎藥治愈。絕大多數肛周膿腫，已有膿液形成時很難自愈，且肛周膿腫如果不積極治療，可能逐步蔓延形成巨大膿腫，從局部感染擴散至更大范圍感染，甚至引起全身感染，建議肛周膿腫患者一旦確診要盡早手術治療。