短暫性腦缺血發作主要病因與血管或血流動力學相關，目前主要有如下幾種假說： 1、微栓子學說，頸動脈下端的斑塊形成微栓子造成不穩定斑塊，或小脂質顆粒脫落，阻塞遠端血管供血。但因血流動力改變后，可能被沖開，或小血栓自溶； 2、心臟疾病，如房顫、惡性心律失常，有短暫性供血障礙，可能造成一過性供血不足，病人出現相關神經功能缺損，如偏癱、語言障礙、感覺障礙等表現； 3、大血管狹窄，如頸動脈或椎動脈等嚴重狹窄。