體外沖擊波碎石雖然對病人的創傷非常小，但對人體組織沒有一點波及是不可能的。石頭打碎的過程中對膽道系、身體的其它部位有所觸及，所以在治療的過程中存在風險。如果心臟功能不好，可能會存在膽心反射，碎的過程中會引起心臟本身潛在疾病的發作，造成病人出現心跳驟停、呼吸驟停、腎功能衰竭、肝功能衰竭這些。所以我們臨床應用中要注意，保證心、肝、腎、呼吸功能正常的情況下才允許手術，還要保持膽道通暢，如果膽道不通暢，碎石后會造成病人梗阻性黃疸、高燒，疼痛，身體條件又不允許做手術，可能引起生命意外，給臨床治療和臨床操作帶來很大困擾。