孩子腹瀉和便秘交替可能是胃腸道功能的問題。患兒先出現腹瀉，過兩天后因腹瀉后胃腸功能弱，胃腸道功能需要恢復的過程，飲食量會明顯減少，在飲食量減少的過程當中胃腸道的吸收功能仍在進行，所以會出現腹瀉痊愈后有兩三天不排泄。不主張治療，一般超過三天以上才處理。隨著飲食的增多，一般情況好轉，患兒可恢復正常。如果孩子的大便味道比較酸臭或酸餿，建議減少飲食量。但是牛奶蛋白過敏的孩子，也會出現便秘、腹瀉交替出現；脾胃比較弱的孩子，出現腹瀉和便秘交替較多。一般情況，便秘主張三天以上才去處理，包括用益生菌、多吃纖維素、開塞露、鹽水灌腸等。絕大多數孩子的便秘跟肛門有關，肛門狹窄、巨結腸、胃腸道功能差等會引起便秘。長期便秘的孩子，若吃得精或吃得太少，處于低消耗的狀態，體質比較虛弱，大便量不多，要逐漸增加飲食量，飲食量上去后，大便才能明顯緩解，如果飲食量上不去，便秘不太能緩解。