克汀病的主要病因是缺碘，尤其是孕婦缺碘以后會對胎兒造成影響。正常人如果缺碘，會導致甲狀腺腫大，影響機體的甲狀腺激素合成。如果孕婦缺碘，會造成胎兒碘的攝入明顯不足，尤其是胎兒發育的關鍵時期，即前4個月，胎兒的甲狀腺逐漸發育，在孕4個月以后胎兒本身會有攝入碘、合成甲狀腺激素的功能，甲狀腺基本具有分泌激素的功能。如果孕婦缺乏碘，勢必也會造成胎兒缺碘，胎兒缺碘以后會影響自身的中樞神經系統發育，包括大腦以及智力的發育，都會受到很大的影響。因此克汀病主要的病因是碘缺乏，尤其是在胎兒期母體缺碘以后，勢必會造成胎兒缺碘，從而影響胎兒甲狀腺的發育，包括胎兒甲狀腺激素的合成。