陰莖損傷首先要判斷其損傷的程度。如為單純的皮膚損傷，可考慮植皮、做皮瓣以解決皮膚損傷問題；如為海綿體損傷，可根據海綿體損傷的程度，決定是否做血管吻合，做海綿體縫合止血；如為陰莖完全缺失，甚至外傷導致皮膚缺損，需根據不同狀態決定不同的手術方式。在臨床上經常會求助于泌尿科大夫或者整形科大夫，甚至在臨床上會由整形大夫和泌尿大夫一起會診，首先弄清楚缺損的原因，缺損的程度，根據其缺損程度確定做手術方式。