纖維支氣管鏡治療肺部疾病，主要的目的有3個： 1、通過纖維支氣管鏡取出深部的標本，做相應的病原學檢查。病原學檢出的陽性率就會大大提高，如果有明確的病原，對肺炎的治療就有針對性，可以提高內部全身用藥治療的效果； 2、通過支氣管鏡吸出氣道內的分泌物，通過支氣管肺泡灌洗術清除局部的炎癥，促進肺部的恢復； 3、可以通過支氣管鏡局部給藥，使藥物在肺組織的局部的濃度增高，促進肺部炎癥的愈合。